La società fu fondata da James Clack (1944-) che alla Stanford University, insieme ad alcuni studenti, aveva sviluppato una nuova tecnologia per implementare un sistema integrato hardware e software per la grafica 3D con prestazioni eccellenti.
La produzione della società si specializzò in dispositivi elettronici che impiegavano la tecnologia del silicio. Lo sviluppo portò alla realizzazione delle prime workstation grafiche con prestazioni di assoluto riguardo, divenendo rapidamente un successo commerciale.
La macchina di maggior successo fu la SGI 3130, una workstation UNIX basata sul processore Motorola 68030 con un coprocessore matematico Weitek. Nel 1992 SGI realizza il primo processore MIPS a 64 bit.
Nel 2009 la società è costretta a dichiarare bancarotta e a vendere tutti i suoi beni alla Rackable Systems che successivamente rinomina la società in Silicon Graphics International.